Στο Νεολιθικό Μουσείο Διρού στεγάζονται τα ευρήματα από το γειτονικό σπήλαιο «Αλεπότρυπα». Το σπήλαιο χρησιμοποιήθηκε ως καταφύγιο, σπίτι, νεκροταφείο και τόπος λατρείας. Ο επισκέπτης μπορεί να δει κεραμικά, διάφορα όπλα, εργαλεία, κοσμήματα, οστά ανθρώπων και ζώων, καθώς και οψιανού από τη Μήλο.