Το Αρχαιολογικό Μουσείο Θήρας κτίσθηκε το 1960 για να αντικαταστήσει το παλαιό μουσείο, που είχε κατασκευασθεί το 1902 και το οποίο καταστράφηκε στους σεισμούς του 1956.

Η ανέγερση του νέου Μουσείου ολοκληρώνεται αυτήν την περίοδο. Συλλογές που περιλαμβάνει:

• Γλυπτά από την αρχαϊκή μέχρι και τη ρωμαϊκή εποχή.
• Επιγραφές από την αρχαϊκή μέχρι και τη ρωμαϊκή εποχή.
• Κεραμική και πήλινα ειδώλια από τη γεωμετρική μέχρι και την ελληνιστική εποχή.